El museu de prehistòria va ser creat per a evitar la dispersió de les troballes relacionades amb l'antiguitat. Així, mostra elements que van des de la prehistòria fins a la València medieval, entre els quals destaca el guerrer de Moixent, una peça datada en el segle IV AC trobada en el poblat de la Bastida dels Alcuses (Moixent). El Conjunt, conegut com Centre de Cultura Mediterrània La Benificencia alberga també un Museu d'Etnologia que mostra l'evolució dels costums de la societat rural tradicional. A més, disposa de diverses sales (que en el seu dia van ser aules d'estudi dels asilats) on se celebren interessants exposicions temporals.